필라멘트 추적 및 편집
뉴런 및 기타 필라멘트 구조의 네트워크 분석은 이러한 네트워크의 형태 및 리모델링 기능을 연구하고 이해하는데 큰 관심을 기울임
- 이것은 뇌의 기능과 질병 영향 및 치료에 대한 이해를 높이는데 도움이 됨.
Amira 소프트웨어를 사용하면, 뉴런(Neurons)이나 혈관(Blood vessels)과 같은 필라멘트 구조의 3D 이미지를 추적, 분석 및 정량화 할 수 있음
- 필라멘트 네트워크를 재구성하고 길이, 두께, 방향, 순위 등의 측정 값을 계산하여 생생한 3D 렌더링으로 시각화 할 수 있음.
- 추적은 응용 프로그램과 필요에 따라 자동 또는 대화식으로 수행할 수 있음.
템플릿 매칭 알고리즘은 노이즈가 있는 극 저온 전자현미경(Cryo-EM) 데이터에서 미세 필라멘트를 자동으로 감지하고 추적함
- Amira 소프트웨어를 사용하면 결과 그래프를 편집하여 필라멘트로 잘못 식별된 이미지 특징을 제거하거나 네트워크의 누락된 부분을 추가할 수 있음.
DTI 분석
뇌의 상호 연결성을 이해하는 것은 기능적 뇌 연구에 필수적
- 이를 통해 연구자들은 뇌의 다양한 부분이 어떻게 고차원적 인지 기능과 운동 능력을 공동으로 조율하는지 더 잘 이해할 수 있음.
Amira 소프트웨어를 사용하면, 이미지를 Talairach 좌표로 변환하여 전체 DTI 분석 워크 플로우를 수행 할 수 있음
- 그런 다음 여러 뇌 이미지를 참조(Reference) 뇌에 매핑할 수 있음.
- 뇌 이미지가 정렬되면, 그라디언트 이미지를 텐서 필드로 변환하고, 최신 시각화 도구를 사용하여 신경 섬유 다발(Nerve fiber bundles)을 추적하고 시각화 할 수 있음.
- 편의를 위해 연구원은 MRI 뇌 데이터에서 두개골과 주변 조직을 자동으로 제거 할 수 있음.
뇌 관류(Perfusion) 분석
뇌 관류 연구는 연구자와 과학자가 뇌졸중이나 알츠하이머, 치매와 같은 다른 뇌 조직 질환의 영향을 이해하는데 도움이 됨
- 뇌졸중의 정확한 위치와 지속시간은 뇌졸중의 기능적 영향을 판단하는데 도움이 됨.
Amira 소프트웨어를 사용하면, 관류 강조(Perfusion weighted) MRI 및 CT 영상에서 뇌 관류를 분석할 수 있음
- 이 분석에는 평균 이동 시간(MTT, Mean transit time), 뇌 혈류 량(CBF, Cerebral blood flow), 뇌 혈액량(CBV, Cerebral blood volume) 계산이 포함됨.
High Content Screening (HCS)
신경퇴행성 질환(Neurodegenerative), 신경 발생(Neurogenesis), 그리고 신경독성학(Neurotoxicology) 분야에서 실험관 내 신경과학(Vitro neuroscience) 연구가 상당히 성장했음
- 신경돌기 성장(Neurite outgrowth)과 시냅스 형성(Synaptogenesis)은 뉴런의 건강과 기능을 평가하는데 있어 핵심적인 기준 임.
- 그러나 시험관 내(In vitro)에서도 신경돌기 성장의 형태를 식별하는 것은 어려움.
신경 돌기와 시냅스 형성 지점을 수동으로 추적하는 연구자들은 가변성과 확장성 보족이라는 문제에 직면해 있음
- Amira Software의 3차원 신경과학 기술은 3D 모델의 신경 형태를 정확하고 효율적으로 정량화 하여 이 연구의 고 처리량 요구를 충족할 수 있음.
