세포 검출
세포 회전 타원체(Cellular spheroids)는 기존 세포 단층(Monolayers)보다 생체 내 조직을 더 잘 표현하는 3D 세포 배양으로, 암, 당뇨병(Diabetes mellitus), 줄기세포 등 다양한 응용 분야에서 연구자들의 연구 능력을 향상 시킴
- 그러나, 이러한 3D 다세포 객체에서의 세포 분석은, 특히 연구 대상을 손상시키지 않고 서는 정확하게 분석하기 어려움.
Amira 소프트웨어는 이러한 스페로이드(Spheroids)의 3D 이미지 데이터에서 세포를 자동으로 분리하고 개별 세포와 그 핵에 대한 체적, 형태 계측 및 강도 측정을 수행할 수 있음
- Amira 소프트웨어는 또한 기존의 2D 세포 단층 분석에도 도움을 줌.
상관관계(Correlative) 이미징
Amira 소프트웨어는 다중 모달리티 영상 기술 분야에서 오래동안 활용되어 왔으며, 다양한 영상 모달리티의 데이터를 다루는 많은 연구자들이 선호하는 도구
- Amira Software의 아키텍처는 다중 볼륨 데이터 처리 및 시각화를 처음부터 지원 함.
- Amira Software 표준 버전에 통합된 Multi-Planar Workroom 자동 등록 도구는 가장 일반적으로 사용되는 자동 등록 지표 및 최적화 도구를 활용하여 데이터 요구 사항에 맞게 등록 매개변수를 조정할 수 있는 유연성을 제공 함.
멤브레인 검출
Amira 소프트웨어는 필라멘트 및 멤브레인과 같은 세포 특징을 자동으로 검출하여 세분화 속도를 높임
- Amira Software는 저온 전자 현미경 (Cryo-EM)에 대한 고급 이미지 분석과 통계 분석을 수행하여 이러한 개별 구조의 데이터를 결합하고, 노이즈를 평균화하고 대비를 높여 더 높은 해상도의 합성 모델을 생성함.
필라멘트 추적
Amira 소프트웨어를 사용하면 템플릿-매칭 알고리즘을 사용하여, 노이즈가 많은 저온 전자현미경(Cryo-EM) 또는 DualBeam™ 데이터에서 미세 필라멘트를 자동으로 검출하고 추적할 수 있음
- 또한, Amira 소프트웨어를 사용하면 과학들은 필라멘트 네트워크를 재구성하고 결과 그래프를 편집하여 필라멘트로 잘못 식별된 이미지 형상을 제거하거나 네트워크의 누락된 부분을 추가할 수 있음.
- 필라멘트 그래프는 양, 길이, 두께, 방향, 순위 등의 매개 변수를 측정하여 정량화 할 수 있음.
- 재구성된 모델과 계산된 매개 변수에서 매력적인 3D 렌더링을 만들 수 있음.
High Content Screening (HCS)
Amira 소프트웨어는 면역 종양학(Immuno-oncology), 신경 과학(Neuroscience), 배아 줄기 세포(Organoid) 건강 등 HCS에서 사용되는 가장 까다로운 과학 및 실험 모델을 연구할 수 있는 다중 채널 정량 분석 기능을 제공 함.
놀라운 속도와 유연성을 갖춘 Amira 소프트웨어는 구조 및 세포 생물학부터 3D 모델의 신경 및 스페로이드 형태학에 이르기까지 다양한 연구 분야에서 고급 2D-5D 바이오 이미징 워크플로우를 지원 함
- 이러한 고급 분석을 용이하게 하기 위해 Amira Software는 지능형 노이즈 제거 기능을 포함하여 향상된 교육 및 예측을 위한 딥 러닝 기능을 제공.
다중 채널 및 시계열 시각화
Amira Software를 위한 새로운 Xplore5D 확장 기능을 사용하면 생명 과학자들은 이미지 크기나 메모리 제한에 대한 걱정 없이 하나의 플랫폼에서 대용량 다중 채널 및 시계열 데이터를 쉽게 시각화하고, 상호 관계를 분석하고, 처리할 수 있음
- Xplore5D는 Smart Multichannel Series(SMS) 파일 형식을 사용하여 모든 이미징 데이터를 압축하면서도 수집 과정에서 수집된 귀중한 정보를 손실하지 않도록 지원 함.
